
临床医学论文-胰腺癌组织中BRAF表达的初步研究.doc




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1、临床医学论文-胰腺癌组织中BRAF表达的初步研究作者:程张军,石欣,卫文俊,汤永辉,高乃荣摘要目的:了解BRAF基因在正常胰腺和胰腺癌组织中的表达水平。
2、方法:6例胰腺癌标本取自胰腺癌手术患者,3例正常胰腺组织取自外伤性胰腺损伤需切除部分胰腺者。
3、用Trizol法抽提每份组织的总RNA,分别进行紫外分光光度计测定、琼脂糖凝胶电泳及Labonchip检测,对总RNA进行质控;应用实时定量PCR技术检测正常胰腺和胰腺癌组织BRAF的mRNA水平;应用Westernblot检测BRAF的蛋白表达水平。
4、结果:BRAFmRNA水平在正常胰腺组织中为.00025,胰腺癌组织中为.00109,上调56倍;Westernblot显示,正常胰腺组织BRAF蛋白表达为50,胰腺癌组织为60,上调17倍。
5、结论:胰腺癌组织中BRAFmRNA和蛋白表达水平均明显上调,其可能的调控机制及生物学效应还有待进一步研究。
6、关键词胰腺癌;BRAF;实时定量聚合酶链反应;WesternblotBRAF(vrafmurinesaraviraloncogenehomologB基因是RAF家族成员之一,能诱导禽原代细胞增殖和NIH3T3细胞分化,是一种癌基因。
7、自Davies等1报道约66%的恶性黑色素瘤和15的结肠癌中BRAF基因存在体细胞错义突变后,该基因与肿瘤关系的研究渐成热点,但其在胰腺癌中的表达尚不清楚。
8、本研究应用实时定量PCR及Westernblot技术检测正常胰腺和胰腺癌组织中BRAF的表达水平,以探讨该基因在胰腺癌发生、发展中可能的作用。
1材料和方法1标本来源与病人签署知情同意书后,收集东南大学附属中大医院20XX年612月胰腺癌手术切除标本7例(C1C7,其中C5号标本降解弃用),所有标本均经病理检查证实为胰腺导管腺癌,其中男性3例,女性3例,年龄5671岁,平均2岁。
临床分期采用1987年国际抗癌协会(UICC)的TNM分期标准,其中期1例、期1例、期2例、期2例。
正常胰腺组织3例(N1N,取自外伤性胰腺损伤需切除部分胰腺者。
手术切除后立即切取标本,快速液氮冷冻,-80保存。
2主要试剂和仪器TrizolRNA提取试剂盒(Sangon公司),逆转录酶Superscript(Invitrogen公司),SybrGreen(Invitrogen公司),InvitrogenRTPCR试剂盒(Invitrogen公司),QIAGENRNeasyKit(QIAGEN公司),Agilent2100Bioanalyzer(Agilent公司),兔抗人BRAF多克隆抗体sc166(SantaCruz公司),羊抗兔抗体(AmershamBiosciences公司)。
3总RNA抽提用Trizol法按操作说明抽提每份正常胰腺及胰腺癌组织总RNA。
采用无RNA酶的DNA酶处理,以提高RNA纯度,并使用QIAGENRNeasyKit进一步纯化总RNA,操作方法按说明进行。
分光光度计测定总RNA的纯度,琼脂糖凝胶电泳初步评价总RNA质量,用Agilent2100分析仪通过Labonchip进一步判定RNA样品的完整性。
不符合质量标准的总RNA弃用,并重新抽提。
4实时定量PCR应用Primerpremier0软件,参照BRAF基因序列设计引物,上游引物为5GGCAGAGTGCCTCAAAAAGAA3,下游引物为5AACCAGCCCGATTCAAGGA3,actin被用作管家基因,上游引物为5GCAGAAGGAAATCACAGCCCT3,下游引物为5GCTGATCCACATCTGCTGGAA3,由上海博亚公司合成。
每份标本取5g总RNA,在逆转录酶Superscript(Invitrogen公司)作用下合成cDNA,加入引物1l、荧光染料SybrGreen5l,总反应体积25l,按InvitrogenRTPCRkit操作说明进行PCR扩增,反应条件:50孵育2min,9510min,接着进行45个循环,9515s,591min。
定量方法采用比较Ct法。
5Westernblot分析200mg组织经研磨粉碎,加入1000l新鲜配制的、冷的蛋白裂解液50mmolL-1TrisHCl,pH5,150mmolL-1NaCl,2mmolL-1EDTA,质量分数为1%的十二烷基磺酸钠(SDS),每10ml加入1片蛋白酶抑制剂,充分裂解后裂解液经14000rmin-1离心10min,取上清液并测定蛋白浓度。
取40g蛋白与上样缓冲液混合,煮沸5min,置于SDS变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,电转移到PVDF膜,用1BSA封闭。
稀释度11000的sc166于4过夜,加入相应的二抗室温下孵育60min,抗体检查按试剂盒说明书进行。
应用GeneSnap软件(GeneGenomeBioimaging,Syngene公司)进行定量分析。
2结果1总RNA抽提及质量鉴定结果总RNA的OD260/OD280之值在0之间。
琼脂糖凝胶电泳,18s和28s电泳条带清晰,28s和18s亮度之比2(图。
Labonchip检测分析,18s和28s双峰比例及位置均正常,无降解杂峰出现(图,说明总RNA纯度高、无降解、质量好。
正常胰腺组织胰腺癌组织2正常胰腺和胰腺癌组织BRAFmRNA表达水平PCR产物的定量方法采用比较Ct法,即先通过一系列的参数设定分析,得到不同样本相对于待测基因的Ct值(Cyclethreshold,即每个反应管内的荧光信号到达设定的域值时所经历的循环数),再根据每个样品的参照基因将目的基因归一化,得到Ct=Ct待测基因Ct管家基因,再转换为起始模板量I=2Ct。
根据以上计算方法获得BRAF基因的起始模板量,从而反映出该基因在不同样本中的表达水平2。
BRAF基因平均模板量(M)在正常组织中为.00025,胰腺癌组织中为.00109(表图,与正常胰腺组织相比,胰腺癌组织中BRAF基因表达上调56倍。
图3正常胰腺和胰腺癌组织中BRAF基因的表达注:I为起始模板量,M为平均模板量3正常胰腺和胰腺癌组织BRAF蛋白表达的水平提取正常胰腺和胰腺癌组织的蛋白作Westernblot分析,比较BRAF的蛋白表达。
结果表明,所有正常胰腺组织只有很弱的BRAF蛋白表达,而胰腺癌组织中则有较强的BRAF蛋白表达。
经过计算机扫描后定量分析,BRAF蛋白表达正常胰腺组织为50,胰腺癌组织为60,上调17倍(图。
图4Westernblot检查BRAF在正常胰腺和胰腺癌组织中的表达3讨论BRAF基因位于染色体7q34,长约190kb,转录mRNA长5kb,编码783氨基酸的蛋白,分子质量为9495kDa3。
在经典的RAS/RAF/MEK/ERK/MAPK(MEK为mitogen/extracellularsignalregulatedkinase,ERK为extracellularsignalregulatedkinase,MAPK为mitogenactivatedproteinkinase)通路中,BRAF有着重要的作用,是RAS最为关键的效应分子,对MEK/ERK的激活最为重要45。
与其它两种RAF蛋白(ARAF、RAF不同,除神经、睾丸和脾脏外的正常组织中,BRAF表达极低或不表达4,但其MEK激酶活性却显著高于ARAF和RAF1蛋白6。
BRAF激活后能依次磷酸化并激活MEK和ERK,在细胞的不同位置存在多种ERK底物,包括转录因子、核糖体蛋白、酶和细胞骨架蛋白等,持续激活的ERK能影响多种癌的肿瘤标志物78。
因此,维持BRAF基因的正常对维持细胞的正常功能非常重要,一旦该基因表达改变,就会使生物学功能发生紊乱,使其介导的信号通路失调控,最终导致细胞转化甚至恶变。
本研究应用实时定量PCR及Westernblot技术,检测了3例正常胰腺、6例胰腺癌组织中BRAFmRNA和蛋白水平,发现BRAF在胰腺癌组织中的表达明显高于正常胰腺组织。
由于目前对该基因与胰腺癌的相关性研究仍很少,我们推测其表达水平的上调可能由其上游的KRAS或Rap1基因的改变引起,或由其自身的激活性突变或基因扩增所导致,是否存在其他调节机制尚不清楚。
本研究结果提示,BRAF过表达对胰腺癌发生和发展的生物学意义值得进一步研究。
由于样本例数限制,BRAF这种表达差异是否具有统计学意义,以及胰腺癌中BRAF基因表达水平是否与临床病理分期及淋巴结转移有关,尚待进一步探讨。
参考文献1DAVIESH,BIGNELLGR,COXC,etal.MutationsoftheBRAFgeneinhumancancerJ.Nature,20XX,2CHANGJT,CHENIH,LIAOCT,etal.AreversetranscriptionparativerealtimePCRmethodforquantitativedetectionofangiogenicgrowthfactorsinheadandneckcancerpatientsJ.ClinBiochem,20XX,3MEYERP,SERGIC,GARBEC.PolymorphismsoftheBRAFgenepredisposemalestomalignantmelanomaJ.JCarcinog,20XX,4HUSERM,LUCKETTJ,CHILOECHESA,etal.MEKkinaseactivityisnotnecessaryforRaf1functionJ.EMBOJ,20XX,.5MIKULAM,SCHREIBERM,HUSAKZ,etal.Embryoniclethalityandfetalliverapoptosisinmicelackingthecraf1geneJ.EMBOJ,20XX,.6MERCERKE,PRITCHARDCA.Rafproteinsandcancer:BRafisidentifiedasamutationaltargetJ.BiochimBiophysActa,20XX,7PEARSONG,ROBINSONF,BEERSGIBSONT,etal.Mitogenactivatedprotein(MAP)kinasepathways:regulationandphysiologicalfunctionsJ.EndocrRev,20XX,8HANAHAND,WEINBERGRA.ThehallmarksofcancerJ.Cell,20XX,。
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